主要研究兴趣包括：基因（蛋白）功能预测、大规模组学数据整合、功能连锁网络构建和生物网络分析、疾病基因和基因模块预测、代谢网络重建和模拟，及基于新测序技术的小片断DNA序列的组装和基因剪切亚型（splicing isoform）鉴定及剪切机制对蛋白质功能和生物网络的影响的算法开发和应用。
主要研究经历包括：（1）开发了一基于新测序手段（454 sequencing technology) 自动组装mRNA小片断序列并鉴定基因剪切亚型的新算法，并和实验工作结合发表于Nature Methods（共同第一作者）。（2）开发了整合基因组学、蛋白质组学、转录组学等大规模信息资源来预测蛋白功能的概率模型及二次数据库。应用此一模型对酵母和小鼠全基因组基因功能(Gene Ontology)预测。其中，对酵母基因的预测结果已被酵母研究领域的权威数据库－ Saccharomyces Genome Database（SGD）收录及引用。在参与小鼠全基因组基因功能预测评估的9个世界知名实验团队中，以基因功能预测的准确性领先于其他算法。此一模型还被应用于小鼠全基因组基因表型的预测。（3）系统地研究了酶功能和蛋白序列同源性的定量关系，开发了一精确预测酶功能的生物信息学工具，对包括模式动植物在内的245个基因组进行了全基因组的酶功能预测. 其中一篇研究成果被选入“Faculty of 1000 Biology”。酶系列研究成果至今已被包括“Nature Review Molecular Cell Biology”在内的90几篇文章引用。

2005-2008 美国哈佛大学医学院 博士后 生物信息学
1998-2004 美国华盛顿大学（圣路易斯） 博士 生物信息学
1995-1998 清华大学 硕士 应用微生物
1991-1995 上海交通大学 学士 生物化学工程

1. , , , , , , . Enhanced oral absorption of paclitaxel in N-deoxycholic acid-N, O-hydroxyethyl chitosan micellar system. Journal of pharmaceutical sciences. 2010
2. . test 1234. 2008
3. , , , , , , , , . CPG15, a new factor upregulated after ischemic brain injury, contributes to neuronal network re-establishment after glutamate-induced injury. J Neurotrauma. 2007